前行政院衛生署中醫藥委員會委員陳旺全醫師表示，台灣因氣候炎熱且潮濕，而大部分的中藥材都怕潮濕、高溫的環境，放久容易變質減低原有的藥效，所以在保存上就必須特別注意，正確存放中藥的方式，應是放置乾燥、通風處，避免陽光直射而變質，若有過期、變質或變色的情形應避免服（使）用。
常見中藥材的正確保存方法：
（1） 中藥飲片：將藥材放置於陰涼乾燥處，避免陽光照射，或者可放置於密封、不透光的真空罐裡，隔絕空氣進入，而有些藥材因含水量和營養成分高，建議放於冰箱內保存，例如枸杞、紅棗、人參、當歸、天門冬…等，一旦若發現中藥材有發霉、變色或是有油味時，則不宜再使用。
（2） 濃縮中藥：一般只要在室溫下放置於陰涼乾燥處，並避免日光曝曬即可，若需長期服用，建議可存放於防潮箱或冰箱冷藏，避免吸潮結塊而造成藥物變質。
（3） 水煎劑：已經煎煮好的藥湯，若沒有喝完，應存放冰箱冷藏，一般不建議隔夜服用，即使放置在冰箱冷藏室中，也不應超過3天，以免藥液變質影響健康。
行政院衛生署自2004年即提出「建構中藥用藥安全環境」第一期計畫，以建立中藥品質科學化之評估標準，實施中藥材包裝標示、中藥材重金屬、農藥殘留、微生物等檢測規範，執行以來已大大降低中藥材誤用混用之情形；而目前「第二期（2010－2014）建構中藥用藥安全環境計畫」也持續為中藥用藥安全把關。
此計畫朝中藥材管理三階段之時程加緊實施管控：第一階段為推動中藥材之包裝標示，以確認產品責任歸屬；第二階段為針對重金屬、異常物質及黃麴毒素等，陸續訂定公告各項限量標準，以確保中藥材之使用安全衛生；第三階段則致力完備中藥材之源頭管理機制，對進口產品文書認證及落地追蹤等工作加以落實持續推進。
其中，陳旺全醫師說明，衛生署中醫藥委員會推動「中藥材包裝標示」，規定324種常見中藥材的包裝必須標示品名、重量、製造日期、保存期限，還有製造商、進口商、販賣商的名稱及地址，以確認產品責任歸屬，一旦消費者發現問題，就可立即追溯源頭；此外，國內的濃縮中藥也都通過GMP（藥品優良製造規範）認證的藥商所生產，所有製造流程都有控管，對於重金屬、生菌素等微生物都有安全規範，民眾可不必過於擔心。