自今年4月起，爆發藥品安全風暴，一波波問題藥品因原料主成分、賦形劑不符規定陸續下架，從胃藥、感冒藥、鈣片、降血糖、抗組織胺及止痛藥等各種國人常用藥品均出現問題。清查發現，此次衛福部食藥署網頁公布的100餘項因遭查獲「藥品使用不符規定之原料藥」而回收的問題藥品項目中，竟然高達逾4分之1，即20餘品項，衛福部早在2013年就已發現藥品成分有問題，與發給的藥品許可不合，卻包庇藥商同意非法藥品就地合法
調查發現，2013年3月間，當時兼代食藥署的衛福部常次許銘能和當時的食品藥物管理局長康照洲，在與藥商組成的公會、協會幹部開會後，同意問題藥品只要已上市5年無重大嚴重不良反應事件發生，就以「長期臨床使用經驗」取代依法必須完成的「藥品BE臨床試驗報告」，藥商只要向食藥署申請變更或補發核可就可繼續生產這些已變更原料或賦形劑的問題藥品，等於衛福部官員讓民眾成為違法藥商的「白老鼠」。食藥署於2013年底將發生爭議的3841件問題藥品中，以「臨床使用」取代「臨床試驗」方式就地合法藥品高達2929項，衛福部、食藥署官員明顯放水，包庇、圖利違法藥商
立委林淑芬直指，實際上依藥事法相關規定，未經核准，藥商擅自變更主成分、賦形劑等，已影響藥品療效，構成藥事法中定義的「偽藥」、「劣藥」，但衛福部一直以來都是「放水放很大！」她將彙整相關事證，將衛福部、食藥署官員許銘能、康照洲等移送檢調和監察院調查偵辦
最後該次名為「台灣藥品優質化策略討論會」，實為將問題藥品就地合法化會議，做出決議，「藥品上市5年為合理之臨床使用經驗；2009年1月1日以前製造販售之藥品，如無重大嚴重不良反應或療效不等事件發生者，『得以其臨床經驗取代BE報告』；又2009年1月1日以後製造販售之藥品，2年內需完成BE試驗報告，所完成之BE報告留廠備查」，屆時食藥署若抽審未通過者，應切結不製造、販售，未切結者，廢止該項藥品許可證
衛生署食品藥物管理局隨即在2013年3月28日，將會議決議行文三大製藥公、協會，公文中白紙黑字違法同意藥商就地合法。該局並於同年的9月17日將改制後兼代食藥署的衛福部常次許銘能報告「台灣藥品優質化執行後續策略」的執行現況，許銘能亦同意了此一放水讓藥商就地合法化作法。至2013年底原本清查的3841件問題藥品案，其中有2929件、逾7成5以「未涉及BE變更」直接予以合法，最後只有5件需重作BE臨床試驗報告
但林淑芬指出，如今爆發藥品安全風暴，在衛福部食藥品網站上公布，今年被要求下架「產品回收」的100餘件問題藥品中，就有超過4分之1是列名當年3841件問題藥品的黑名單中，且最後就已「未涉及BE變更」輕騎過關，衛福部、食藥署明顯包庇、圖利違法藥商，罔顧民眾藥品安全