農委會表示，聯合國糧食及農業組織（FAO）及世界動物衛生組織（OIE）近期提出預警，目前已有哥倫比亞、厄瓜多爾、埃及、以色列和泰國等5國通報發生吳郭魚感染吳郭魚湖泊病毒（Tilapia Lake Virus, TiLV），並引發吳郭魚大量死亡案例。
六月初桃園市1名吳郭魚養殖業者通報桃園市動物保護處，該場吳郭魚出現大量死亡情形，相關檢體經送畜衛所以OIE推薦的RT-PCR檢測方法檢驗，昨確診為吳郭魚「湖泊病毒病」，經病毒核酸序列分析比對，與以色列發現的病毒相似度為93%。
農委會表示，此病不是OIE表列疾病，亦非我國動物傳染病防治條例所列之法定動物傳染病，不會傳染給人或畜禽，因此，沒有食品安全問題。
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桃園市觀音區福山路三段8-22號池，發現吳郭魚新興傳染病「湖泊病毒病」，是全球第6個確診國家，飼主楊萬來養殖漁業有3、40年的經驗，楊萬來研判染病主因是年初桃園大缺水，因為各種作物種植需要池塘灌溉，池塘出水多、進水少、水質不佳才會染病。
清查抽驗周遭3公里內的養殖池，暫時未發現類似狀況，對於死亡的吳郭魚，已經要求業者按照廢棄物清理法處理，未來只要吳郭魚染病痊癒，還是可以開放買賣。
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桃園市一處吳郭魚養殖戶發現吳郭魚湖泊病毒病，農委會防檢局追查發現部分吳郭魚購自台南麻豆一處水禽場，數量約5000台斤，台南市動保處日前派員前往麻豆採檢，結果出爐並未檢出病毒。
農委會防檢局追查發現部分吳郭魚購自台南麻豆一處水禽場，數量約5000台斤，台南市動保處日前派員前往麻豆採檢，結果出爐並未檢出病毒。
動保處也強調說，湖泊病毒只會感染吳郭魚，染病吳郭魚會呈現眼睛潰爛、腹部潮紅出血，根本就賣不出去，也不會傳染給人或畜禽，沒有食品安全問題，民眾只要選購新鮮吳郭魚，並且煮熟就可以放心食用。
嘉義縣政府家畜疾病防治所除已針對縣內3家魚苗場進行採樣送驗，也籲請吳郭魚養殖業者加強落實相關防疫工作。
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農委會防檢局表示，病魚會出現眼睛突出及身體出血等症狀，民眾選購時，只要小心很容易辨識。根據目前報告顯示，罹病的都是吳郭魚，由於這是一個全世界新興病害，相關研究還沒有很透徹，不過可以確定的是這種病毒不會感染人與禽畜，而截至目前為止，也沒有感染其他魚種的情況，所以在食品安全方面大家可以不用擔心。往後會將這吳郭魚湖泊病毒列為輸入魚苗檢疫項目之一，而發生疫情國家的吳郭魚也不能輸入台灣。
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桃園市政府動物保護處已進行生物移動管制，並成立桃園市吳郭魚湖泊病毒疫情緊急應變小組，籲請養殖業者務必留意並加強防疫；會同專家學者於6月13、14及17日主動採檢計23場次，也主動調查及輔導案例場，要求養殖業者務必留意並加強防疫。
目前已知前三口的魚苗來源不同，後三口調查中；六口養殖池的水源則都引自桃園大圳的支圳，最終流入大海，彼此並不相通；八之廿二號池吳郭魚死亡高峰在前幾天，目前死亡情況已減少很多，十六日驗出的八之廿一號、八之新三十號池，距離第一口八之廿二號池約一公里，雖驗到病毒，但無魚群死亡現象；昨天新增的八之廿四號、八之三十二號、九之十六號三口池，距離八之廿二號池約二公里，也無魚群死亡現象。
隨行的台大獸醫系副教授陳媺玫表示，病毒感染最難控制的是水和水鳥，所幸對於販賣魚管控確實，目前發病的魚即使痊癒，也要觀察一段時間才能重新販賣，這些魚免疫力反而會更好，目前防疫單位所能做的就是做好「移動管制」，雖然發現病情，防範傳播出去。
台大獸醫系教授張本恆說，針對湖泊病毒，目前國際上沒有標準的防疫處置作法，案例場移動管制是目前最佳的處置方法，至於其他的防疫處置措施，建議完成案例場周邊吳郭魚場監測、現場調查後再作討論。
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吳郭魚湖泊病毒蔓延，昨日再新增一例，累計染病案例場已有七個。
農委會主委林聰賢親上火線召開記者會，強調在未查出病毒來源的情形下，考量國內魚苗主要來自中國，中國據悉有相關疫情，因此全面禁止中國與其他疫區魚苗進口，同時檢討、明確訂定埤塘放養相關規定。
中國雖無正式通報相關疫情，但據業界私下了解及漁情監測，中國其實有類似的狀況，因此要以邊境管理、內部清查雙管齊下，找出感染源。
從首例感染魚場來看，十一公頃、放養五種魚類，密度過高，也違反「蓄水池、圳不得人為放殖任何魚介、家禽，或於水面上從事一切營利事業」規範。但為了兼顧當地農民生計與灌溉用水的水質，會先檢視實際放養情況，再訂定更具體規範，並進行輔導改善，希望回歸自然放養。
對於「混養」其他魚種造成染病的說法，當地的飼養戶則認為不太可能，指「混養」魚種的埤塘比比皆是且多年如此，要染病早就染病。
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根據桃園農田水利會蓄水池、圳魚介捕採管理要點，埤塘僅能採捕魚苗，不能放養任何魚介、家禽或從事營利事業。副主委陳吉仲今對於吳郭魚疫情也表示，已清查吳郭魚11家種苗場，都呈現陰性反應，針對進口魚苗部分，則全面禁止，發生案例場將進行移動管制二週，屆時抽驗過後為陰性，才會解除移動管制。
桃園市市長鄭文燦呼籲全部撲殺、補償，林聰賢表示，OIE都建議以移動管制、監測為主，也是目前最有效方式，而且這次發生水域有11公頃，還有其他經濟魚種，不受這種病毒影響，暫不考慮撲殺。
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農委會主委林聰賢表示，埤塘過度放養，要求水利會管制，並請水試所研究自然放養管理方式。不過此舉卻引發合法養殖戶反彈，認為農委會讓非法的養魚埤塘「就地合法化」。對此，農委會解釋，埤塘養魚已有悠久歷史，農委會並未讓埤塘養魚合法化。
黃金城說，早期農田水利會將埤塘承租出去，部分租戶就有養魚，這個現象一直都存在；其實，要禁止埤塘養魚，政府只要發公文頒布禁令，相當簡單，但考慮到如此倉促做法會讓這些人斷了生計，應該研議其他有誘因的方式，讓埤塘能「自然放養」，這些人也能維持生活。
未來希望可用其他方式引導埤塘業者自然放養，例如經濟部已開放埤塘建構太陽能發電設備，未來或許可以租給太陽能業者，有額外收益，也能符合自然放養的目的，農委會並未讓埤塘養魚合法化。
桃園台灣鯛爆出感染湖泊病毒後，一度傳出病源來自台南種魚場，南市動保處對4場種魚場檢驗，均未檢出，但消息一出已讓台南養殖業受到衝擊。
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桃園市觀音區已經確認7口魚池飼養吳郭魚罹患湖泊病毒，農委會決定將檢測範圍由3公里擴大到5公里，總計增加30口池塘，22日派員會同桃園市政府、桃園農田水利會等單位進行採樣，預估下周就可知道檢測結果。
原本採樣範圍為3公里，但因為持續出現遭感染結果，為求慎重，農委會將採樣範圍由3公里擴大到5公里，該範圍內共有30口池塘飼養吳郭魚，列入檢測。
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連結：吳郭魚病毒肆虐 弘光檢驗中心協助判定（2017/06/27）
弘光科技大學「食品安全與超微量檢驗中心」，可針對湖泊病毒進行檢驗服務，可以驗出魚是否有染病，提早進行隔離。擔心魚場是否受感染，可以將魚體送檢解剖，取魚的眼窩、或肝臟、或腦部檢驗，就可以判斷出是否染上湖泊病毒，檢驗中心從收到魚檢體到結果出爐，最快兩個小時就可以做出正確判斷。
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連結：桃園吳郭魚池7口陽性魚池 無異常情況解除移動管制（2017/07/03）
行政院農委會防檢局表示，針對桃園「吳郭魚湖泊病毒病」疫情，原先進行 14 天移動管制的 7 口魚池，後續沒有出現魚群異常死亡，因此解除移動管制。不過擴大檢驗半徑 5 公里內的 24 場吳郭魚池檢驗結果仍尚未出爐。
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日前防檢局擴大案例場半徑檢驗範圍，從三公里增加至五公里，經過檢驗後，檢驗結果於7月4日出爐，24場吳郭魚場中，有2場檢測結果湖泊病毒核酸呈陽性反應，目前總計9場
上述呈現陽性反應的2場魚場，雖然現場無魚隻異常死亡或病變情況，
目前吳郭魚湖泊病毒仍侷限在桃園市觀音區一帶，且僅有首例吳郭魚的死亡率較高(約6.4%)，