食品藥物管理署今預告包裝食品、散裝食品、食品添加物含基因改造食品原料標示應遵行事項等3草案，其中包裝食品、食品添加物相關草案預計2016年元旦實施，散裝食品因類型複雜，預計2016年元旦起分3階段施行，連攤販也納管。
在上述3草案中，共同要點包括，規定應標示「基因改造」或「含基因改造」字樣；食品製造過程中雖使用基改食品原料，但最終產品已不含轉殖基因片段或轉殖蛋白質者，不適用此規定；原本屬非基改食品原料，若摻入基改食品原料，即使是非有意，當其含量超過3%，仍視為基改食品原料。
由於散裝食品的型態相當多，草案中的規定也較複雜，將分3階段逐步實施，分別於2016、17、18年元旦施行，其中第1階段管理對象為已辦理公司或商業登記的業者，適用品項針對農產品，到第2階段則將管理對象擴大，即使是沒有辦理公司或商業登記的業者如攤販等也納管，預計到第3階段，市售所有豆漿、豆腐、豆花、豆乾、豆皮、大豆蛋白製素肉產品皆屬管理品項。
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